有人指政府干預港大遴選副校長，行政會議召集人林煥光指從未聽過行會干預陳校自主的言論。

林煥光認為各界應尊重及捍衞院校自主權，將人事任命等問題留給大學既定的系統和方法決定，不受外界干擾。

對於政改，他又指每人都可以因應自己的個人政治信念和喜惡支持方案和制度，但認為立法會議員的考慮應超越個人考慮，小心聽取選民意願和詳細了解基本法及人大常委8‧31決定。