政府公開南丫海難內部調查報告部分內容，報告透露17名相關人員，包括13名在職及4名已退休人員，過往執行與南丫四號有關工作時的「行為不當」。調查小組建議，要對其中13名在職人員採取紀律行動，當中2人是首長級人員。而在13人當中，部門已經就其中7人正式展開紀律程序，並已警告其餘6人。   調查小組又透露，調查過程中遇到懷疑涉及刑事罪行的問題，已轉介警方處理。警方已收到整份調查報告，而在徵詢過律政司的意見後，刑事檢控專員警告，若現階段公開整份報告，極有可能影響刑事調查及檢控工作，甚至有可能造仍不公平審訊，故調查小組實在無法公開交代所有報告內容。   報告指海事處問題極多　運作儲存紀錄亦不理想   小組強調，報告集中調查海事處人員過去就「南丫四號」執行相關職務的情況，目的是找出有無任何缺失或不足，而不在於確立員工的不當行為與「南丫四號」沉沒造成傷亡的因果關係，亦無權力判定涉及的在職或退休人員，以及海事處整體的刑事和民事責任。   報告亦批評，海事處管理文化有問題，很多時候都是上司等待下屬，如果上司無收到報告，就當作沒有問題。報告認為，有關作風，在海事處不同職級的主管，以至最高層人員，都普遍出現，員工之間這種因循及舊有做法，難免導致海事處在執行監管本地船隻的制度上重重出錯，既有疏忽，亦有不足。   另外，報告亦提到，海事處在備存運作紀錄和行政紀錄中，部分竟然無法找到，即使找到亦不完整。問題根源似乎是海事處人員不願以書面溝通或備存書面紀錄，而不單是記錄管理欠佳，口耳相傳的指示方式，容易產生誤傳、誤解和誤會，更無法追溯商議和決定過程，亦無從得知重要情況的例外情況和酌情考慮因素，情況極不理想。